玉林市科技館標志整體為科技藍，有四層喻意。用顏色的變化將標志變化出玉林“YL”首字母，像展翅飛翔的小鳥，意喻托起科技的夢想；字母Y又像科學的種子在發芽，意喻青少年像茁壯成長的小樹苗，沐浴科技陽光；標志整體像“一只眼”，且包含了星星、太陽、月亮等元素，意喻通過科技館這只“眼”,瞭望科學的星辰大海；又仿佛“一只手”，去觸摸未知世界，探索科學奧秘，與玉林市科技館“自然探趣、科學探秘、生存探索、環保探能、生活探智、核能探源”等6大主題展區相呼應。

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