為進一步增強職工的歸屬感和使命感，經過前期征集、投票并經所長辦公會審定，中國中醫科學院中國醫史文獻研究所所訓、所徽正式發布啟用。
  所訓
  博學于文，毓才以史，辨章醫道，考鏡源流。
  “博學于文”，語出《論語·雍也》：“君子博學于文，約之以禮”。文，指文獻典籍，亦包括典章文物和文化知識，代表中國醫史文獻研究所一史三文（醫史、文獻、文物、文化）的主體研究方向。
  “毓才以史”，“毓”通“育”。為國育才，需要“以史為鏡、以史明志”。中國醫史文獻研究所作為國家中醫藥管理局高水平中醫藥重點學科建設單位，承擔著培育中醫藥傳承創新人才的使命。
  “辨章醫道，考鏡源流”化裁自章學誠《校讎通義》“辨章學術,考鏡源流”，是中醫醫史文獻研究的重要方法。
  所訓意在激勵中國醫史文獻研究所職工同學廣泛地學習古今中外的文獻典籍，做到知識豐富廣博、文化底蘊深厚；研究中醫藥學發生發展的歷史，探索中醫藥學發展規律，以史為鑒，服務現實，啟迪未來。
  所徽
  中國醫史文獻研究所所徽整體風格與“中國中醫科學院”院徽風格接近，分為外環和內圓兩個區域，外環為所名區，內圓為標識區。整體造型為圓形，圓融的造型更能體現中華傳統文化特色，更加符合中國人的審美觀念。顏色為綠色，寓意生命力與新生，蘊含生機盎然的創新之義，象征中醫醫史文獻研究事業在傳承創新中蓬勃發展。
  外環區的上下兩部，分別題寫中、英文所名。中文所名選用“舒同體”（中國書法家協會主席舒同曾為中國醫史文獻研究所題寫所名），英文所名選用大寫EU-B7 Regular體。
  內圓區采取開放漸進式樣，代表對知識學問追求的無止境。主體標識采用甲骨文“文”“史”進行組合，代表我所一史三文（醫史、文獻、文物、文化）的主體研究方向。
  所徽既富傳統元素、也含現代符號，集中反映了中國中醫科學院中國醫史文獻研究所的精神意蘊和文化內涵。

  所訓、所徽是中國中醫科學院中國醫史文獻研究所文化內涵和精神實質的集中體現，也是對外宣傳和展示的亮麗名片。所訓、所徽作為無形資產和文化標識，必須尊重和愛護，不得擅自更改所徽圖形、比例、色彩、字體、組合方式等。未經授權，任何單位和個人不得將其用于商業目的，不得在不當場合使用。

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